海南二代測序實驗室的布局和建設_中南
二代測序實驗室布局分區(qū)
1. 二代測序實驗室大致分為樣本前處理區(qū)、試劑儲存和準備區(qū)、樣本制備區(qū)、文庫制備區(qū)、雜交捕獲區(qū)/多重PCR區(qū)域(**擴增區(qū))、文庫擴增區(qū)(第二擴增區(qū))、文庫檢測與質控區(qū)、測序區(qū)、數據存貯區(qū)。
2.各工作區(qū)的空氣和人員流向應按照《醫(yī)療機構臨床基因擴增檢驗實驗室工作導則》的要求來設計。
3. 前處理和建庫時,血液樣本應與組織樣本分開。
二代測序實驗室的建設要求
1.NGS檢測人員的資質要求:
① NGS檢測技術人員應具備臨床病理學、分子生物學的相關專業(yè)大專以上學歷,并經過NGS技術的理論與技能培訓合格。
② 數據分析人員應具有臨床醫(yī)學或分子生物學或遺傳學知識背景并經生物信息學培訓。
③ 最終報告應由中級或碩士以上具有病理學背景、經培訓合格的本單位執(zhí)業(yè)醫(yī)師或者授權簽字人(醫(yī)學博士學位或**職稱)審核。
2.NGS檢測試劑及項目要求
、 試劑和測序平臺均應選擇中國食品藥品監(jiān)督管理總局(CFDA)認可產品。涉及到實驗室自配試劑,應該有嚴格的試劑制備標準操作規(guī)程(SOP),需經過臨床實驗室自建項目(LDT)驗證合格才可使用。
、 每個NGS檢測項目在驗證時需要根據建庫方法、測序平臺和分析工具以及不同的突變類型包括,單堿基突變single nucleotidevariant,SNVs、小片段插入或者缺失(Indels)、基因拷貝數變異、染色體結構變異,以及不同的樣本類型(如FFPE組織、新鮮組織、全血、胸水等)對特定panel的準確性、精確性、敏感性、特異性等性能參數進行LDT驗證。
、 不同測序深度的靈敏度及特異性數據,確定不同樣本的可信的測序深度。經驗證后,SOP發(fā)生的任何改動,包括試劑、儀器、基因項目等都需要重新做驗證。驗證實驗結果簽名留底備案。
3.NGS檢測實驗室的質量管理要求:NGS檢測主要包括實驗操作和生物信息
學分析兩部分。實驗操作部分包括樣本準備、文庫制備、編碼、目標區(qū)域富集、測序等;生物信息學分析部分包括定位、比對、變異識別、變異注釋、變異解讀及報告等。 |
地 區(qū):海南 等 級: 參考價格: 認 證: 規(guī) 格: 供貨數量: 供貨能力: 發(fā)布日期:2021-06-17 16:58:09 有 效 期:長期有效 發(fā)布用戶:lc1689 發(fā) 布 IP:113.88.110.165
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